重测序数据fastp数据质控及fastQC质量评估

 

001、

fastp -i sample_name_1.fq.gz -o sample_name_qc_1P.fastq.gz -I sample_name_2.fq.gz -O sample_name_qc_2P.fastq.gz --thread 4 -g -q 20 -u 30 -l 150 --overlap_diff_limit 1 --overlap_diff_percent_limit 10 
## 数据质控

fastqc -o ./evaluation -t 1 sample_name_trim_1P.fastq.gz sample_name_trim_2P.fastq.gz
## 质量评估

。